UCLA Academic Technology Services HomeServicesClassesContactJobs
Search

SAS Library
Slicing Interactions in SAS


This page was adapted from a page created by Oliver Schabenberger.  We thank Professor Schabenberger for permission to adapt and distribute this page via our web site.


Introduction
Physical Slicing
Slicing without separating the data
        Slicing in PROC MIXED vs. GLM
Comparing cell means in the presence of significant interactions
       In PROC GLM
       In PROC MIXED (preferred)
Slicing three-way and higher order interactions 


Introduction

Physical slicing

data exper1;
  input block location treat y;
  datalines;
<data goes here>
;
run;
proc sort data=exper1; by location; run;
proc glm data=exper1;
  class block treat;
  model y = block treat;
  by location;
run;

Slicing without separating the data

--------------------------------------
|        |         Tissue Type         |
|        |---------------------------|
|        |  1   |  2    |  3   |  4   |
|--------+------+------+------+------|
|Tempera-|      |      |       |      |
|ture    |      |       |      |       |
|--------|      |      |       |      |
|-8      |  96.8|  81.5|  61.8|  98.3|
|--------+------+------+------+------|
|-7      |  87.0|  58.6|  43.6|  96.7|
|--------+------+------+------+------|
|-6      |  72.6|  51.7|  33.6|  89.5|
|--------+------+------+------+------|
|-5      |  51.5|  33.7|  25.0|  75.4|
|--------+------+------+------+------|
|-4      |  36.6|  25.5|  15.9|  64.4|
|--------+------+------+------+------|
|-3      |  23.9|   7.4|  14.7|   17.1|
|--------+------+------+------+------|
|-2      |  17.0|   7.2|  11.8|   15.7|
|--------+------+------+------+------|
|0       |   4.6|   3.5|    6.5|   4.1|
--------------------------------------

        Plot of LEAK*TEMP.  Symbol is value of TISSUE.

       ­
   100 Ã                                                   4
       ­                                             4      1
       ­                                       4      1
       ­                                                   2
    75 Ã                                 4      1
 L     ­
 e     ­                           4                        3
 a     ­                                             2
 k  50 Ã                                 1      2
 a     ­                                             3
 g     ­                           1
 e     ­                                 2      3
    25 Ã                     1      2     3
       ­               1      4     3
       ­               3      3
       ­  1            2     2
     0 Ã
       ­
       -----------------------------------------------------
          0    -1     -2    -3    -4    -5     -6    -7    -8

                             Temperature

NOTE: 4 obs hidden.

proc glm data=leakage;
  class tissue temp;
  model leak = tissue temp tissue*temp;
run; quit;

General Linear Models Procedure

Class Level Information
Class    Levels    Values
TISSUE        4    1 2 3 4
TEMP          8    0 -2 -3 -4 -5 -6 -7 -8

Number of observations in data set = 160

Source   DF     Sum of Squares        Mean Square   F Value      Pr > F
Model    31     158585.4375175       5115.6592748     48.70      0.0001
Error   128      13444.5222800        105.0353303
Total   159     172029.9597975

Source      DF         Type III SS        Mean Square   F Value      Pr > F
TISSUE       3       23847.0616725      7949.0205575      75.68     0.0001
TEMP         7      121221.3735775     17317.3390825     164.87     0.0001
TISSUE*TEMP 21      13517.0022675        643.6667746      6.13      0.0001

proc glm data=leakage;
  class tissue temp;
  model leak = tissue temp tissue*temp;
  lsmeans tissue*temp / slice=temp;
run;

TISSUE*TEMP Effect Sliced by TEMP for LEAK

                   Sum of            Mean
TEMP     DF        Squares           Square          F Value     Pr > F

 0        3         25.533695          8.511232        0.0810     0.9702
-2        3        288.976095         96.325365        0.9171     0.4347
-3        3        696.837335        232.279112       2.2114      0.0899
-4        3       6589.763440      2196.587813       20.9128     0.0001
-5        3       7427.236375      2475.745458       23.5706     0.0001
-6        3       8898.054000      2966.018000       28.2383     0.0001
-7        3       9107.437500      3035.812500       28.9028     0.0001
-8        3       4330.225500      1443.408500       13.7421     0.0001

proc sort data=leakage; by temp; run;
proc glm data=leakage;
  class tissue;
  model leak = tissue;
  by temp;
run; quit;

Temp   Source      DF          Type I SS
 0     TISSUE       3        25.53369500
-2     TISSUE       3       288.97609500
-3     TISSUE       3       696.83733500
-4     TISSUE       3      6589.76344000
-5     TISSUE       3      7427.23637500
-6     TISSUE       3      8898.05400000
-7     TISSUE       3      9107.43750000
-8     TISSUE       3      4330.22550000

Slicing in PROC MIXED

proc mixed data=leakage;
  class tissue temp;
  model leak = tissue temp tissue*temp;
  lsmeans tissue*temp / slice=temp;
run;

       Tests of Effect Slices

Effect       TEMP   NDF   DDF        F  Pr > F

TISSUE*TEMP   0       3   128     0.08  0.9702
TISSUE*TEMP  -2       3   128     0.92  0.4347
TISSUE*TEMP  -3       3   128     2.21  0.0899
TISSUE*TEMP  -4       3   128    20.91  0.0001
TISSUE*TEMP  -5       3   128    23.57  0.0001
TISSUE*TEMP  -6       3   128    28.24  0.0001
TISSUE*TEMP  -7       3   128    28.90  0.0001
TISSUE*TEMP  -8       3   128    13.74  0.0001

Comparing Cell Means in the Presence of Significant Interactions

Effect       TEMP   NDF   DDF        F  Pr > F

TISSUE*TEMP   0       3   128     0.08  0.9702
TISSUE*TEMP  -2       3   128     0.92  0.4347
TISSUE*TEMP  -3       3   128     2.21  0.0899
TISSUE*TEMP  -4       3   128    20.91  0.0001
TISSUE*TEMP  -5       3   128    23.57  0.0001
TISSUE*TEMP  -6       3   128    28.24  0.0001
TISSUE*TEMP  -7       3   128    28.90  0.0001
TISSUE*TEMP  -8       3   128    13.74  0.0001

proc glm data=leakage;
  class tissue temp;
  model leak = tissue temp tissue*temp;
  lsmeans tissue*temp / pdiff;
run;

General Linear Models Procedure
Least Squares Means

TISSUE   TEMP          LEAK    LSMEAN
                     LSMEAN    Number

1         0        4.6320000     1
1        -2       17.0000000     2
1        -3       23.8800000     3
1        -4       36.6480000     4
1        -5       51.4500000     5
1        -6       72.6000000     6
1        -7       86.9600000     7
1        -8       96.8000000     8
2         0        3.4780000     9
2        -2        7.2280000    10
2        -3        7.3540000    11
2        -4       25.4800000    12
2        -5       33.7000000    13
2        -6       51.7200000    14
2        -7       58.6200000    15
2        -8       81.4600000    16
3         0        6.5080000    17
3        -2       11.8400000    18
3        -3       14.7400000    19
3        -4       15.9200000    20
3        -5       24.9800000    21
3        -6       33.6400000    22
3        -7       43.5800000    23
3        -8       61.7800000    24
4         0        4.1160000    25
4        -2       15.6740000    26
4        -3       17.0760000    27
4        -4       64.3600000    28
4        -5       75.3800000    29
4        -6       89.5200000    30
4        -7       96.7400000    31
4        -8       98.2600000    32

Pr > |T| H0: LSMEAN(i)=LSMEAN(j)

   i/j     1       2        3       4        5       6        7       8
   1   .      0.0586  0.0036   0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001
   2  0.0586   .      0.2905   0.0029  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001
   3  0.0036  0.2905   .       0.0510  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001
   4  0.0001  0.0029  0.0510   .       0.0240  0.0001  0.0001  0.0001
   5  0.0001  0.0001  0.0001  0.0240   .       0.0014  0.0001  0.0001
   6  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0014    .      0.0285  0.0003
   7  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0285   .      0.1315
   8  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0003  0.1315   .
   9  0.8590  0.0390  0.0020  0.0001  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  10  0.6895  0.1341  0.0113  0.0001  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  11  0.6752  0.1392  0.0120  0.0001  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  12  0.0016  0.1931  0.8054  0.0873  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  13  0.0001  0.0111  0.1322  0.6500  0.0071   0.0001  0.0001  0.0001
  14  0.0001  0.0001  0.0001  0.0216  0.9668   0.0016  0.0001  0.0001
  15  0.0001  0.0001  0.0001  0.0009  0.2707   0.0329  0.0001  0.0001
  16  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001 0.0001  0.1741   0.3977  0.0195
  17  0.7727  0.1080  0.0083  0.0001  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  18  0.2682  0.4275  0.0655  0.0002  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  19  0.1214  0.7279  0.1609  0.0010  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  20  0.0840  0.8679  0.2217  0.0017  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  21  0.0021  0.2205  0.8655  0.0742  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  22  0.0001  0.0114  0.1346  0.6434  0.0069   0.0001  0.0001  0.0001
  23  0.0001  0.0001  0.0029  0.2869  0.2269   0.0001  0.0001  0.0001
  24  0.0001  0.0001  0.0001  0.0002  0.1135   0.0975  0.0002  0.0001
  25  0.9367  0.0490  0.0028  0.0001  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  26  0.0909  0.8382  0.2078  0.0015  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  27  0.0571  0.9907  0.2958  0.0031  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  28  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0485   0.2059  0.0007  0.0001
  29  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0003   0.6687  0.0764  0.0012
  30  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0101  0.6935  0.2635
  31  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0003  0.1338  0.9926
  32  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0001  0.0837  0.8221

Pr > |T| H0: LSMEAN(i)=LSMEAN(j)

   i/j     9      10       11      12       13      14       15      16
   1  0.8590  0.6895  0.6752  0.0016  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
   2  0.0390  0.1341  0.1392  0.1931  0.0111   0.0001  0.0001  0.0001
   3  0.0020  0.0113  0.0120  0.8054  0.1322   0.0001  0.0001  0.0001
   4  0.0001  0.0001  0.0001  0.0873  0.6500   0.0216  0.0009  0.0001
   5  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0071   0.9668  0.2707  0.0001
   6  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0016  0.0329  0.1741
   7  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0001  0.0001  0.3977
   8  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0001  0.0001  0.0195
   9   .      0.5639  0.5509   0.0009  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001
  10  0.5639   .      0.9845  0.0056   0.0001  0.0001  0.0001  0.0001
  11  0.5509  0.9845   .      0.0060   0.0001  0.0001  0.0001  0.0001
  12  0.0009  0.0056  0.0060   .       0.2070  0.0001  0.0001  0.0001
  13  0.0001  0.0001  0.0001  0.2070   .       0.0063  0.0002  0.0001
  14  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0063    .      0.2891  0.0001
  15  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0002   0.2891   .      0.0006
  16  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0001  0.0006   .
  17  0.6410  0.9117  0.8964  0.0041  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  18  0.1994  0.4781  0.4901  0.0373  0.0010   0.0001  0.0001  0.0001
  19  0.0847  0.2486  0.2566  0.1000  0.0041   0.0001  0.0001  0.0001
  20  0.0571  0.1823  0.1887  0.1427  0.0070   0.0001  0.0001  0.0001
  21  0.0012  0.0070  0.0075  0.9386  0.1809   0.0001  0.0001  0.0001
  22  0.0001  0.0001  0.0001  0.2104  0.9926   0.0061  0.0002  0.0001
  23  0.0001  0.0001  0.0001  0.0060  0.1299   0.2115  0.0219  0.0001
  24  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.1231  0.6267  0.0029
  25  0.9217  0.6320  0.6182  0.0013  0.0001   0.0001  0.0001  0.0001
  26  0.0622  0.1949  0.2016  0.1328  0.0062   0.0001  0.0001  0.0001
  27  0.0379  0.1311  0.1361  0.1971  0.0115   0.0001  0.0001  0.0001
  28  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0534  0.3775  0.0094
  29  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0004  0.0108  0.3500
  30  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0001  0.0001  0.2160
  31  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0001  0.0001  0.0199
  32  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001  0.0001   0.0001  0.0001  0.0107
 

TISSUE   TEMP          LEAK    LSMEAN
                     LSMEAN    Number
1        -4       36.6480000     4
2        -4       25.4800000    12
3        -4       15.9200000    20
4        -4       64.3600000    28

Tissue vs  Tissue   at Temp  Row  Column   p-value
   1         2         -4      12     4      0.0873
   1         3         -4      20     4      0.0017
   1         4         -4      28     4      0.0001
   2         3         -4      20    12      0.1427
   2         4         -4      28    12      0.0001
   3         4         -4      28    20      0.0001 (not shown)

proc mixed data=leakage;
  class tissue temp;
  model leak = tissue temp tissue*temp;
  lsmeans tissue*temp / diff;
run;

                                                    Std
  Effect    TISSUE TEMP _TISSUE _TEMP Difference   Error  DF      t Pr > |t|

TISSUE*TEMP   1     0       1     -2     -12.37      6.48 128  -1.91   0.0586
TISSUE*TEMP   1     0       1     -3     -19.25      6.48 128  -2.97   0.0036
TISSUE*TEMP   1     0       1     -4     -32.02      6.48 128  -4.94   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       1     -5     -46.82      6.48 128  -7.22   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       1     -6     -67.97      6.48 128 -10.49   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       1     -7     -82.33      6.48 128 -12.70   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       1     -8     -92.17      6.48 128 -14.22   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       2     0         1.15     6.48 128    0.18   0.8590
TISSUE*TEMP   1     0       2     -2       -2.60     6.48 128  -0.40    0.6895
TISSUE*TEMP   1     0       2     -3       -2.72     6.48 128  -0.42    0.6752
TISSUE*TEMP   1     0       2     -4     -20.85      6.48 128  -3.22   0.0016
TISSUE*TEMP   1     0       2     -5     -29.07      6.48 128  -4.48   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       2     -6     -47.09      6.48 128  -7.26   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       2     -7     -53.99      6.48 128  -8.33   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       2     -8     -76.83      6.48 128 -11.85   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       3     0        -1.88     6.48 128  -0.29    0.7727
TISSUE*TEMP   1     0       3     -2       -7.21     6.48 128  -1.11    0.2682
TISSUE*TEMP   1     0       3     -3     -10.11      6.48 128  -1.56   0.1214
TISSUE*TEMP   1     0       3     -4     -11.29      6.48 128  -1.74   0.0840
TISSUE*TEMP   1     0       3     -5     -20.35      6.48 128  -3.14   0.0021
TISSUE*TEMP   1     0       3     -6     -29.01      6.48 128  -4.48   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       3     -7     -38.95      6.48 128  -6.01   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       3     -8     -57.15      6.48 128  -8.82   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       4     0         0.52     6.48 128    0.08   0.9367
TISSUE*TEMP   1     0       4     -2     -11.04      6.48 128  -1.70   0.0909
TISSUE*TEMP   1     0       4     -3     -12.44      6.48 128  -1.92   0.0571
TISSUE*TEMP   1     0       4     -4     -59.73      6.48 128  -9.21   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       4     -5     -70.75      6.48 128 -10.91   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       4     -6     -84.89      6.48 128 -13.10   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       4     -7     -92.11      6.48 128 -14.21   0.0001
TISSUE*TEMP   1     0       4     -8     -93.63      6.48 128 -14.44   0.0001
TISSUE*TEMP   1     -2      1     -3      -6.88      6.48 128  -1.06   0.2905
TISSUE*TEMP   1     -2      1     -4     -19.65      6.48 128  -3.03   0.0029
TISSUE*TEMP   1     -2      1     -5     -34.45      6.48 128  -5.31   0.0001
TISSUE*TEMP   1     -2      1     -6     -55.60      6.48 128  -8.58   0.0001
TISSUE*TEMP   1     -2      1     -7     -69.96      6.48 128 -10.79   0.0001
TISSUE*TEMP   1     -2      1     -8     -79.80      6.48 128 -12.31   0.0001
TISSUE*TEMP   1     -2      2     0        13.52     6.48 128    2.09   0.0390
TISSUE*TEMP   1     -2      2     -2        9.77     6.48 128    1.51   0.1341
TISSUE*TEMP   1     -2      2     -3        9.65     6.48 128    1.49   0.1392
TISSUE*TEMP   1     -2      2     -4      -8.48      6.48 128  -1.31   0.1931
TISSUE*TEMP   1     -2      2     -5     -16.70      6.48 128  -2.58   0.0111
TISSUE*TEMP   1     -2      2     -6     -34.72      6.48 128  -5.36   0.0001
TISSUE*TEMP   1     -2      2     -7     -41.62      6.48 128  -6.42   0.0001
TISSUE*TEMP   1     -2      2     -8     -64.46      6.48 128  -9.94   0.0001
TISSUE*TEMP   1     -2      3     0        10.49     6.48 128    1.62   0.1080
TISSUE*TEMP   1     -2      3     -2        5.16     6.48 128    0.80   0.4275
TISSUE*TEMP   1     -2      3     -3        2.26     6.48 128    0.35   0.727

proc mixed data=leakage;
  class tissue temp;
  model leak = tissue temp tissue*temp;
  lsmeans tissue*temp / diff;
  make 'diffs' out=diff noprint;
run;
data diff; set diff;
  if _effect_ = 'TISSUE*TEMP' then do;
     if temp ne _temp then delete;
     if (temp+0) > -4 then delete;
  end;
  LSD05 = tinv(0.975,_df_)*_se_;
  drop _effect_ _se_ _df_;
run;
proc print data=diff label noobs;
  format _diff_ 6.2 LSD05 5.1;
run;

TISSUE TEMP _TISSUE _TEMP Difference      t Pr > |t| LSD05

  1     -4     2      -4      11.17      1.72   0.0873  12.8
  1     -4     3      -4      20.73      3.20   0.0017  12.8
  1     -4     4      -4     -27.71    -4.28    0.0001  12.8
  1     -5     2      -5      17.75      2.74   0.0071  12.8
  1     -5     3      -5      26.47      4.08   0.0001  12.8
  1     -5     4      -5     -23.93    -3.69    0.0003  12.8
  1     -6     2      -6      20.88      3.22   0.0016  12.8
  1     -6     3      -6      38.96      6.01   0.0001  12.8
  1     -6     4      -6     -16.92    -2.61    0.0101  12.8
  1     -7     2      -7      28.34      4.37   0.0001  12.8
  1     -7     3      -7      43.38      6.69   0.0001  12.8
  1     -7     4      -7      -9.78    -1.51    0.1338  12.8
  1     -8     2      -8      15.34      2.37   0.0195  12.8
  1     -8     3      -8      35.02      5.40   0.0001  12.8
  1     -8     4      -8      -1.46    -0.23    0.8221  12.8
  2     -4     3      -4       9.56      1.47   0.1427  12.8
  2     -4     4      -4     -38.88    -6.00    0.0001  12.8
  2     -5     3      -5       8.72      1.35   0.1809  12.8
  2     -5     4      -5     -41.68    -6.43    0.0001  12.8
  2     -6     3      -6      18.08      2.79   0.0061  12.8
  2     -6     4      -6     -37.80    -5.83    0.0001  12.8
  2     -7     3      -7      15.04      2.32   0.0219  12.8
  2     -7     4      -7     -38.12    -5.88    0.0001  12.8
  2     -8     3      -8      19.68      3.04   0.0029  12.8
  2     -8     4      -8     -16.80    -2.59    0.0107  12.8
  3     -4     4      -4     -48.44    -7.47    0.0001  12.8
  3     -5     4      -5     -50.40    -7.78    0.0001  12.8
  3     -6     4      -6     -55.88    -8.62    0.0001  12.8
  3     -7     4      -7     -53.16    -8.20    0.0001  12.8
  3     -8     4      -8     -36.48    -5.63    0.0001  12.8
 

Slicing three-way and higher order interactions

lsmeans a*b*c / slice=a*b;
lsmeans a*b*c / slice=a*c;
lsmeans a*b*c / slice=b*c;

lsmeans a*b*c / slice=(a*b a*c b*c);


How to cite this page

Report an error on this page

UCLA Researchers are invited to our Statistical Consulting Services
We recommend others to our list of Other Resources for Statistical Computing Help
These pages are Copyrighted (c) by UCLA Academic Technology Services


The content of this web site should not be construed as an endorsement of any particular web site, book, or software product by the University of California